Bachelor-/Masterarbeit in mathematischer Modellierung

Max-Planck-Institut für Dynamik komplexer technischer Systeme, Bioprocess Engineering
 
Fachrichtung In silico
Beschreibung der Abschlussarbeit Die Arbeitsgruppe Bioprozesstechnik am Max-Planck-Institut für Dynamik komplexer technischer Systeme bietet im Rahmen einer theoretischen Bachelor- oder Masterarbeit folgendes Thema an:

Modellierung des Zitronensäurezyklus zur Energiegewinnung und Biomassesynthese in tierischen Zellen

Der Zitronensäurezyklus ist im weitesten Sinne eine ringförmige Kaskade aus enzymatischen Reaktionen und ist in tierischen Zellen der effizienteste Weg zur Gewinnung zelluläre Energie. In den von uns untersuchten Madin Darby canine kidney Zellen arbeitet dieser nur langsam und in sich inhomogen. Zwar wurden bereits detaillierte Modelle zur Glykolyse und zum Zellwachstum entwickelt, aber erst die Komplettierung durch den Zitronensäurezyklus erlaubt uns eine eingehende und aufschlussreiche Analyse des Energiehaushaltes der MDCK Zelle. Langfristig sollen diese Erkenntnisse in die Optimierung von Kulturmedien und Zelllinien einfließen um effizientere biotechnologische Prozesse zu ermöglichen.

Inhalte:
• Entwicklung eines mathematischen Modells zur Beschreibung des Zitronensäurezyklus
• Kopplung des Systems mit Zellwachstum sowie mit angrenzenden biochemischen Reaktionswegen
• Evaluierung der Modellhypothesen mit Hilfe von experimentellen Daten
• Verwendung theoretischer Analysemethoden zur Charakterisierung von Einflussfaktoren
• Interpretation der Erkenntnisse mit Hinblick auf den Energiehaushalt der Zelle
Qualifikationen Anforderungen:
• Studium der Biotechnologie, Biosystemtechnik, Bioinformatik oder verwandter Fachrichtungen
• Interesse an Fragestellungen im Bereich Systembiologie und Bioprozesstechnik
• Erfahrung im Bereich mathematische Modellierung und im Umgang mit MATLAB
• Eigeninitiative und ausgeprägte Teamfähigkeit
• Gute Englischkenntnisse (internationales Team, Literaturrecherche)

Die Arbeitsgruppe Bioprozesstechnik Die Arbeitsgruppe untersucht Säugetier-Zellkulturen und die Virusproduktion für Impfstoffe, sowie deren Aufreinigung, aber auch bakterielle Prozesse mit dem Ziel der Regulation, Kontrolle und Optimierung. Dabei werden Erkenntnisse der Ingenieurs-wissenschaften mit der Biotechnologie verknüpft.

Wichtige Themenbereiche sind bei uns:
•Signal-Transduktion während einer Influenza-Infektion
•Mathematische Modellierung von Bioprozessen
•Untersuchung der Virus-Wirtszell-Interaktion
•Zellkultur in verschiedenen Bioreaktoren
•Bakterielle Fermentation von Mischkulturen/Biofilmen
•Protein- und Glykananalytik
•Chromatographische Aufarbeitung von Impfstoffantigenen und Glykoproteinen
Art der Abschlussarbeit Vollzeit
Bewerbungsschluss (Eingangsdatum)
Wie bewerben? Vollständige Bewerbungsunterlagen bitte per email zuschicken.

Interessenten richten Fragen und Bewerbungen bitte an:
Dipl.-Ing. Markus Rehberg
Telefon: +49 (0) 391 - 6110 - 206
E-mail: rehberg[at]mpi-magdeburg.mpg.de
Internet: www.mpi-magdeburg.mpg.de
Anbieter Max-Planck-Institut für Dynamik komplexer technischer Systeme, Bioprocess Engineering
Straße Sandtorstr. 1
Postleitzahl/Stadt 39106 Magdeburg
Land Germany
Website http://www.mpi-magdeburg.mpg.de/
Ansprechpartner/in Dipl.-Ing. Markus Rehberg
Telefon +49 (0) 391 - 6110 - 206
Fax
Email rehberg[at]mpi-magdeburg.mpg.de
Veröffentlicht am Donnerstag, 21. Juni 2012
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