Donnerstag, 14 Mai 2020 10:22

Mit Bioinformatik zur Covid-19-Aufklärung Empfehlung

Prof. James Adjaye, Leiter des Instituts für Stammzellforschung und regenerative Medizin in Düsseldorf, und der Bioinformatiker Wasco Wruck haben eine Meta-Analyse von RNA-Sequenzdaten aus drei Sars-Cov2-Studien durchgeführt, in denen humane Lungenepithelzellen verwendet worden waren.


Auf der Suche nach Genen, die mit dem Angiotensin I umwandelnden Enzym 2 (ACE2) in Verbindung stehen, fanden sie mehrere Gene, die hochsignifikant korrelieren, wie die Transmembranserinprotease 4 (TMPRSS4) sowie unter anderem solche, die mit dem viralen Lebenszyklus zu tun haben und die Interferonantwort auf das Virus hervorrufen. Der erhaltene Datensatz kann zu einem besseren Verständnis der molekularen Mechanismen von COVID-19 beitragen.


Originalpublikation:
Wasco Wruck & James Adjaye (2020). A meta-analysis of transcriptomes of SARS-Cov2 infected human lung epithelial cells identifies transmembrane serine proteases co-expressed with ACE2 and biological processes related to viral entry, immunity, inflammation and cellular stress.

Quelle:
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2020.05.12.091314v1.full.pdf