Die Forschenden haben eine neue Vorhersagemethode namens «CellOT» entwickelt. Diese kann nicht nur bestehende Messdaten von Patientenzellen auswerten und damit die Kenntnis zellulärer Störungsreaktionen erweitern. Es können auch Vorhersagen getroffen werden, wie einzelne Zellen einer/eines PatientIn auf eine Störung reagieren werden, deren Reaktionen noch nicht im Labor gemessen worden sind.
Das führt, so hoffen die ForscherInnen zu genaueren und personalisierten Therapien.
Originalpublikationen:
Bunne, C, Stark, SG, Gut, G, Sarabia del Castillo, J, Lehmann, K-V, Pelkmans, L, Krause, A, Rätsch, G. Learning single-cell perturbation responses using neural optimal transport. Nature Methods (2023). 28 September 2023. DOI: external page10.1038/s41592-023-01969-xcall_made
Research Briefing. Neural optimal transport predicts perturbation responses at the single-cell level. Nature Methods (2023). 28 September 2023. DOI: external page10.1038/s41592-023-01968-ycall_made
Weitere Informationen:
https://ethz.ch/en/news-and-events/